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中國科學院深海科學與工程研究所柏仕杰副研究員為第一作者，張培君研究員和李松海研究員作為通訊作者發表在期刊Water Biology and Security上題為“Similarities and differences in gastrointestinal microbiomes between wild and human-cared spotted dolphins (Stenella attenuata) in natural waters”的一項研究強調了生活在相似的環境中的熱帶斑海豚，食物來源差異是影響其腸道微生物群落組成的重要因素。

腸道微生物在食物消化中起著至關重要的作用，是宿主的第二免疫系統。盡管人們逐漸意識到它們的重要性，但由于采樣困難，科研人員對海洋哺乳動物腸道微生物群落的了解仍然非常有限。

動物自身系統發育地位、生長環境和飲食等是影響腸道微生物組成的主要因素。然而，這三個因素間的從屬地位目前尚不明確。本研團隊先前的一項研究表明處于相似的飲食和水生環境中的海洋哺乳動物，科及以上分類地位的枝系間腸道微生物組存在顯著差異。在此基礎上，本次研究在環境因素上控制同一地理種群的熱帶斑海豚，著重調查了食物變化對其腸道微生物組的影響——野外海豚自然捕食，而人工飼養的海豚飼喂有限種類的食物魚。

該研究使用 16S rRNA 基因的V4區對腸道微生物進行分類，發現野生和人工飼養的海豚在整體以及特定部位的胃腸道微生物群落在結構上存在著顯著差異。有趣的是，它們胃腸道中的微生物多樣性沒有太大差異，這表明差異主要源于微生物群落組成的變化。

研究人員在野生海豚組（五個指示性ASVs）和人工飼養海豚組（三個指示性ASVs）中都發現了指示性微生物。此外，還發現了大量潛在的致病菌，這突顯了未來對海洋哺乳動物腸道微生物學進行全面研究的必要性。

本文的研究結果不僅增強了科研人員對熱帶斑海豚腸道微生物學的理解，還清楚地闡述了同一海洋哺乳動物物種內胃腸道微生物群的相似性和差異，特別是當食物來源的變化在其生態生活中發揮重要作用時。

野生（左）和人工飼養（右）的熱帶斑海豚后腸微生物群落組成在門（a）、科（b）和屬（c）三個分類水平的對照

本文鏈接：https://doi.org/10.1016/j.watbs.2024.100288