仿刺參在高壓培養(yǎng)條件下的基因表達差異
文章來源：供稿/陳家煒 供圖/梁林英 | 發(fā)布時間：2020-04-30 | 【打印】 【關閉】
近日，中科院深海所張海濱研究團隊在期刊BMC Genomics發(fā)表了題為“Insights into high-pressure acclimation: comparative transcriptome analysis of sea cucumber Apostichopus japonicus at different hydrostatic pressure exposures”的文章。研究團隊使用高壓培養(yǎng)裝置模擬深海高壓環(huán)境，通過比較轉錄組分析淺海仿刺參對不同壓力脅迫的分子響應。
研究表明，仿刺參可以在15°C, 25 MPa條件下100%存活至少24小時。在高壓培養(yǎng)后，實驗樣品在常壓條件下仍然可以正常生長。通過比較轉錄組學分析發(fā)現(xiàn)，隨著壓力變化，一部分基因的表達也發(fā)生變化。根據(jù)基因在不同壓力條件下的表達模式，可以將其分為3類：線性相關差異基因、壓力敏感差異基因、高壓誘導差異基因（圖1）。雖然這些基因的表達模式不同，他們所涉及的生物學過程是類似的，包括：基因信息傳遞、泛素化、細胞內吞、MAPK信號轉導、跨膜運輸?shù)取Ｆ渲校核鼗蛢韧套饔茫▓D2）可以共同作用于錯誤折疊蛋白的清除，這兩個生物學過程的上調暗示仿刺參在高壓培養(yǎng)過程中合成了異常蛋白，這或許是高壓導致仿刺參死亡的原因。本實驗所篩選出的差異表達基因，將有助于進一步研究動物對高壓環(huán)境的適應機制。深海所碩士生梁林英和陳家煒為論文共同第一作者。
圖1 基因在不同壓力條件下的表達模式
圖2 參與泛素化和內吞作用的代謝通路示意圖 在高壓下顯著高表達的基因用紅色標出
原文鏈接：https://bmcgenomics.biomedcentral.com/track/pdf/10.1186/s12864-020-6480-9
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