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深海科學與工程研究所
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仿刺參對時間序列壓力脅迫的分子響應

文章來源:供稿/供圖:陳家煒  |  發布時間:2020-04-30  |  【打印】 【關閉

    近日,中科院深海所張海濱研究團隊在期刊Frontiers in Genetics上發表了題為Molecular Response to High Hydrostatic Pressure: Time-Series Transcriptomic Analysis of Shallow-Water Sea Cucumber Apostichopus japonicus的文章。研究團隊使用高壓培養裝置模擬深海高壓環境,通過轉錄組分析淺海仿刺參對壓力脅迫的分子響應。實驗包括:1.高壓環境時間序列(1–24 h)培養;2.進行高壓(25 MPa)培養后,在常壓條件下時間序列恢復(0.5–48 h)培養。 

  研究發現,參與基因信息傳遞的bZIP轉錄因子是對壓力變化最敏感的基因家族,在高壓培養2–4小時后開始顯著高表達。接下來產生響應的生物學過程是泛素化和細胞內吞,與這兩個生物學過程相關的基因家族分別在高壓培養4小時和6小時后開始顯著高表達。 

  另外,研究發現大部分基因在受到高壓脅迫后立即開始調整表達水平(此時尚未檢測到顯著差異),上調或者下調的速率隨時間增加逐漸降低;解除高壓脅迫后,大部分基因立即開始恢復,恢復速率隨時間增加逐漸降低(如圖示)。本研究的結果對深海動物的采樣具有一定的借鑒意義。由于深海樣品在回收至水面的過程中面臨劇烈的壓力變化,如需避免基因表達發生顯著改變,則應在盡量短的時間內完成對樣品的固定。深海所碩士生陳家煒為論文第一作者。 

聚類分析、差異表達分析和主成分分析結果

P0P24:高壓培養024小時

R0.5R48:常壓恢復0.548小時

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